Сериал рассказывает о безумных и комичных приключениях мышонка по имени Дэнжер Маус — самого великого секретного агента во всём мире. Вместе со своим преданным помощником Пенфолдом он выполняет задания от полковника К и сражается с самыми разными врагами. Их миссии всегда наполнены абсурдом, неожиданными поворотами и весёлыми неурядицами, ведь угрозы исходят от могущественных злодеев. Главным противником Дэнжер Мауса становится Барон Сайлас Гринбэк — хитроумная и злобная жаба, одержимая идеей мирового господства. Вместе со своим помощником Сти-летто он разрабатывает всё более нелепые и опасные планы, которые герои пытаются сорвать.