Аниме «Наруто 6» является продолжением серии японских фильмов о приключениях Наруто, первый из которых вышел на экраны в 2002 году. В сюжете шестого фильма рассказывается про то, как государства Шиноби, а именно Травы, Облака, Камня, Песка и Листвы, оказываются на грани новой мировой войны. Причина в том, что четыре из них постигла беда: из скрытых деревень начали исчезать шиноби, владеющие уникальными способностями. И лишь одна деревня Листвы осталась нетронутой. Это вызвало подозрения у других наций, и они потребовали немедленно предоставить им виновника, в противном случае деревня Листвы будет уничтожена. Следы исчезнувших шиноби очень скоро приводят разведчиков Конохи на гору Сумисен, однако времени для выяснения истины совсем нет. Чтобы спасти от уничтожения деревню и не допустить войну, отважный Хатакэ Какаси готов пожертвовать собой, но единственный ученик сэнсея, добрый парнишка Наруто не согласен с таким решением…