Мультсериал повествует о приключениях 16-летнего Питера Паркера, который не так давно был укушен генетически модифицированным пауком, из-за чего приобрел удивительные сверхспособности. Он направляет свои силы Человека-паука на борьбу с преступностью, защищая родной город от могущественных злодеев, таких как Зеленый Гоблин, Доктор Осьминог, Стервятник и других. При этом Питер старается держать в тайне свою супергеройскую личность, чтобы жить нормальной жизнью: подросток продолжает посещать школу, поддерживает тесную дружбу со своими одноклассниками Гвен Стейси и Гарри Озборном и даже устраивается фотографом в газету, чтобы помочь с деньгами своей овдовевшей тете Мэй.