Команда автоботов, следом за победой над десептиконами на Земле, принимает решение возвратиться на Кибертрон. Трансформеры рады завершению войны, ведь теперь тело злейшего врага всего живого Мегатрона покоится на океанском днище. Роботы хотят побыстрее приступить к выполнению следующего задания, заключающегося в восстановлении их родной планеты, разрушенной неизведанными силами. В результате чего автоботы оказались практически бездомными. Вскоре выясняется, что робокары домой вернулись не одни, совместно с ними проникло древнейшее могущественное порождение зла в лице Юникрона, намеревающегося окончательно истребить Кибертрон. Для осуществления своего зловещего плана Юникрону достаточно расправиться с ядром планеты, представляющим собой альт-форму Праймуса — извечным врагом злого начала, и разрушить его. Неприятелю удаётся разыскать прах Мегатрона и вселится в него. Агрессор втягивает героев в новые, ожесточённые бои. Автоботам вновь предстоит суровое сражение и у них нет права проиграть его, иначе их кровная галактика будет вмиг уничтожена и автоботы, и даже и десептиконы, полностью исчезнут. Героев ожидают многие испытания, и если они не найдут союзников — трансформеры обречены погибнуть.