Сюжет разворачивается вокруг секретного учреждения по обучению шпионов под названием «Агентство Д», которое было сформировано благодаря финансированию имперской армии Японии накануне необратимо назревающего международного конфликта, грозящего началом мировой войны. Безликие ученики, прошедшие строгий отбор и получившие фальшивые имена, подвергались в ходе жесткого обучения суровым испытаниям, выводившим их физические возможности на более высокий уровень. Будущие агенты изучали множество иностранных языков, медицину, физику, химию, фармакологию и массу других точных наук, разбавляя полученные знания навыками, получаемыми от профессиональных взломщиков, связистов и даже жиголо, обучавших парней искусству обольщения. А самым загадочным было то, что никто из будущих шпионов не был выпускником армейской академии, так как все они были набраны из лучших студентов обычных учебных учреждений.Во главе «Агентства Д» стоит хладнокровный подполковник Юки, который в прошлом был одним из лучших агентов страны, а теперь передаёт свои бесценные знания новому поколению шпионов. Именно ему предстоит выбрать из множества кандидатов лишь несколько достойных преемников, которые в будущем своими тайными действиями должны будут предоставить Японии выгодное положение на неспокойной мировой арене.