Середина ХІХ столетия, закат правления сёгуна Токугавы. Япония выходит из изоляции, длившейся долгие века, и налаживает тесные связи с Европой. Конфликт достижений западной цивилизации и японской мудрости приводят к потрясениям и столкновениям, зарождению новых учений и появлению далеких от местных традиций идей. Кодо Юкимура широко известен как врачеватель и знаток способов борьбы с человеческими недугами, он совершенствовал свои знания в Голландии. После очередного вызова ко двору, домой доктор не вернулся ни через три, ни через пять дней. Измученная неизвестностью Тидзуру – дочь врача, переодевается самураем, берет в руки семейный меч, которым она виртуозно владеет, и отправляется искать отца в столицу.С наступлением темного времени суток, Тидзуру оказывается в эпицентре схватки между двумя группами самураев, одержавшие победу берут девушку в плен. Удивлению героини не было предела, когда молодые люди рассказали, что они – Синсегуми. Эта группа следит за порядком в городе, и неважно – друг ты или враг, если ты нарушитель, получишь по заслугам. Оказалось, что самураи тоже разыскивают Кодо-сэнсэя, это он положил начало существованию их организации.