Основные события происходят после того, как закончилась великая битва Шиноби. В этой истории главным героем является сын легендарного воина Наруто, который отчаянно пытается выбраться из тени своего знаменитого отца, чтобы добиться не меньшего успеха и славы. Боруто не привык отступать от своих целей, тем более ему очень хочется стать великим воином, который в чем-то будет даже лучше своего могущественного родственника. В настоящее время бывший ниндзя Наруто Узумаки все свое время уделяет работе, поэтому практически не уделяет должного времени воспитанию сына. Естественно, между отцом и его отпрыском происходят многочисленные разногласия, портящие и без того не благополучные семейные отношения. Оба персонажа обладают сильными и упрямыми характерами, которые сближают мужчин и одновременно отдаляют. Кроме того, юный непоседливый Наруто был слишком самоуверенным молодым юношей, что препятствовало любому командному сотрудничеству, которое так важно в любых боевых сражениях. Его наставником становится великий учитель Конохари, который дает Боруто и другим своим ученикам задание, связанное с поимкой кровожадного и опасного медведя. Во время выполнения этой миссии главный герой как никогда проявит свой врожденный эгоизм, а затем встретится с главным врагом своего отца, который известен под именем Саске Учиха. Самое интересное, что главный герой проникается уважением к новому знакомому и даже просит стать его своим учителем. Но как отнесется к такому дерзкому и шокирующему поступку сам Наруто?