Основной сюжет аниме-проекта «Несокрушимая механическая кукла» разворачиваются в альтернативном мире, где наука достигла небывалых высот. Лучшие человеческие умы сосредоточены на разработках различных механизмов, но ничто уже не сможет переплюнуть популярность «автоматов» - механических созданий, практически ничем не отличающихся от людей.Существует несколько видов «автоматов», одни из которых являются лишь глупыми поделками, способными выполнять за человека черновую работу. Другие же обладают потрясающим разумом, наделяющим их возможностью принимать осознанные решения. С одной из таких роботизированных кукол предстоит иметь дело главному герою картины – Райсину Акабанэ, который не так давно потерял всю свою семью.Райсина от жестокой расправы спасла Секо – талантливый изобретатель и настоящий гений. Спасительница предоставляет Райсину возможность натренироваться и отомстить за гибель близких людей, внедрившись в организацию, где, по идее, скрывается убийца. В совершении вендетты парню будет помогать Яйя – лучшее творение Секо. Киборг обязуется выполнять поручения людей, обеспечивая им дорогу к истинной цели, но никто не сомневается, что даже с такой помощницей предстоит хорошо попотеть ради того, чтобы добраться к виновнику недавней трагедии. Сможет ли наш герой достичь цели и покарать поддонка, жестоким образом расправившегося с его семьёй?