События приключенческого аниме вращаются возле милой и доброй девочки по имени Кобато. Юная героиня приходит в мир людей с целью выполнить своё самое сокровенное желание. Ради этого девчушке необходимо присоединиться к жизни местных жителей и врачевать людские сердца, концентрируя осколки их горестей и сердечных печалей в некой волшебной ёмкости. С наполнением чудесной бутылочки, девчушка сможет очутиться там, куда изначально стремилось её сердце. Помогает и присматривает за новоиспечённой землянкой Иорёги — некое могущественное создание, которое в наказание за свои прежние деяния вынужденно пребывать на Земле в обличие бирюзовой плюшевой собачонки. Основной загвоздкой этой парочки является то, что юная героиня, невзирая на всю свою старательность, всё же несколько недоразвита и не особенно-то представляет, как ей следует вести себя на Земле. Например, девица может взять и начать рисовать на асфальте пальцем только потому, что так делали персонажи прочитанной ею манги.На выполнение задания у Кобато есть только один год. В случае если девушка не успеет наполнить специальный сосуд осколками человеческих страданий, она вернётся на небеса и понесёт наказание. Сумеет ли легковерная и по-ребячьи впечатлительная героиня адаптироваться в мире людей и достойной выполнить свою миссию?