Это история об Аято Камино, семнадцатилетнем школьнике из Токио, чудом уцелевшем после произошедшего несколько лет назад нападения неизвестных агрессоров, уничтоживших практически все человечество. И по состоянию на 2015 год крупный мегаполис и некоторые прилегающие территории являются тем безопасным местом, где остатки человеческой цивилизации еще могут проживать без риска быть мгновенно уничтоженными. Поэтому именно из соображений безопасности людям запрещено покидать обозначенный участок, за пределами которого привычный для выживших мир просто перестал существовать. Однажды по пути в школу юноша становится невольным свидетелем вооруженного столкновения – неведомый враг с боем прорывается через охраняемый периметр, а защитники пытаются отразить внезапную атаку, используя не только военную технику, но и гигантских человекоподобных роботов «долемов». Спешащий помочь друзьям в воцарившемся хаосе и неразберихе, он неожиданно встречает таинственную женщину, назвавшуюся Харукой Сито, вместе с которой он впоследствии бежит из города на одном из механических гигантов Ра-Зефоне, с удивлением обнаружив, что только он способен им управлять. И едва оказавшись за границами токийской «специальной зоны», ошеломленный парень осознает, насколько далека от реальности известная ему картина современного мира…