Умный и добродушный паренёк Кубо скромно живет вместе со своей матерью в небольшой деревушке, расположенной на морском побережье мистической Японии. Обладая уникальным волшебным инструментом, способным создавать и оживлять оригами (фигурки из бумаги), Кубо часто занимается тем, что развлекает местных жителей, рассказывая невероятные легенды о великих воинах и ужасных монстрах, устраивая при этом красочные представления. Но паренёк и подумать не мог, что всё его истории реальны…Однажды, сам того не зная, он случайно призывает ужасных духов из своего прошлого, жаждущих свершить кровную месть. В последний момент перепуганного паренька спасает мать, которая произносит древнее заклинание и говорит напоследок сыну, чтобы он отыскал магические доспехи, принадлежащие его отцу – легендарному самураю, не знавшему себе равных. Отправившись в увлекательное и невероятно опасное путешествие вместе с Обезьяной, мистическим хранителем, которого призвала заклинанием мать, и Жуком, отважным воином, служившим ранее отцу, парню предстоит преодолеть немало преград, а также разгадать множество загадок, чтобы узнать великую тайну своего рода и свершить героический подвиг, предначертанный судьбой.