После победы над Администратором, которая далась ценой трагических потерь, в «Underworld» прошло около шести месяцев. Все это долгое время Алиса неустанно приглядывала за практически обездвиженным Кирито, который так и не смог поправиться после огромного скачка напряжения, произошедшего в реальном мире и задевшего STL, где лежал парень. Но теперь над Миром Людей нависает новая опасность: в ближайшее время начнется финальная стадия стресс-теста «Underworld», означающая, что Великие Восточные Врата падут, открыв дорогу огромной армии императора Вектора — жестокого правителя Темной Территории.