Мультсериал продолжает следить за приключениями участников корпорации «Тайна», передвигающихся на специальном фургоне и расследующих самые загадочные преступления, связанные с привидениями, чудовищами и другими паранормальными вещами. Главными героями выступают импульсивный Шэгги Роджерс, привлекательная и энергичная Дафни Блейк, вечно голодный пес Скуби-Ду и его юный племянник Скрэппи-Ду, в отличие от своего дяди отличающийся умом и храбростью.