Соник, во время очередного сражения со своим заклятым врагом доктором Эггманом, случайно разбивает призму парадокса, что не только вызывает разрушение Вселенной, но и отправляет главного героя в параллельную реальность. В этом странном мире все по-другому: Соник и его лучший приятель Тейлз даже не друзья, люди ведут себя как роботы, а на каждом углу подстерегает опасность. В скором времени Сонику удается выяснить, что темный мир называется Нью-Йорк Сити, а главным злодеем здесь является не доктор Эггман, а могущественный Совет хаоса.