2015-й год, Сан-Франциско. Специальный агент Леон и его коллега Ингрид приступают к выполнению сложного задания: им поручено спасти знаменитого ученого от преступной группировки. Тем временем Крис и Джилл проводят расследование появления нового Т-вируса и стремительно распространяющейся вспышки превращений в зомби, охватившей город, но им не удается обнаружить источник заражения. Единственная зацепка, объединяющая жертв, — они были на острове Алькатрас несколько дней назад. Стремясь спасти Сан-Франциско от нашествия зомби, главные герои прибывают на остров, еще не зная, что Алькатрас стал обителью могущественного зла.