Спустя пять лет как бесстрашный спасатель-ныряльщик Джонас Тейлор победил акулу-мегалодона, он присоединился к организации, расследующей экологические преступления, а также удочерил Мэйин, ребенка его погибшей близкой подруги Сюин Чжан. Глубоководная станция «Мана-1», изучающая Марианскую впадину, находит там целую экосистему со множеством гигантских существ, не тронутых эволюцией. Главному герою приходится не только сразиться с доисторическими хищниками, но и противостоять наемникам бизнес-леди Хиллари Дрисколл, заинтересованной в добыче полезных ископаемых на дне океана.