Однажды Сатору случайно закидывает свой бейсбольный мяч в грязную канаву. Пытаясь его достать, мальчик натыкается на миниатюрного самурая Суминоэ Сукунахико, который плохо себя чувствует, поскольку выпил слишком много загрязненной воды. Главный герой решает помочь маленькому воину прийти в себя и забирает его домой, где прячет нового знакомого в ящике стола. Так Сукунахико оказывается в непривычном для себя мире, таящем множество опасностей для крошечных людей, несмотря на их мастерское владение оружием.