Спасаясь от политического заговора, принцесса Селина из маленькой страны в Гималаях летит на самолете в Японию. Неожиданно она попадает под влияние духа с другой планеты, который с помощью нее хочет предупредить землян о большой опасности из космоса. Тем временем на территорию Японии падает метеорит, который приносит на себе чудовищного трехголового дракона под названием Гидора, который начинает уничтожать все на своем пути. Поскольку люди бессильны перед инопланетным монстром, в бой за Землю вступают Годзилла, Родан и Мотра.