Япония, год 1545. Страна разорена кровопролитной гражданской войной, которой не видно конца. Могущественные противники не могут одержать окончательную победу на поле брани. И тогда, для них настает время пустить в ход самое смертоносное оружие: преданные только своим господам тайные кланы ниндзя — воинов тени. Там где бессильны армии, эти хладнокровные убийцы и неуловимые шпионы, обладающие мистическими навыками искусства ниндзицу и владеющими самым невероятным оружием, готовы выполнить любое задание. Воинов тени не должна мучить совесть и терзать сомнения, они — только бессловесное орудие в руках хозяина, слепо выполняющие его волю. Но однажды, юный ниндзя по имени Красная Тень решает поступить по другому…