На гигантском корабле, пришвартованном в бухте райского острова, расположена Пиратская академия, где учатся дети из разных слоев общества, мечтающие стать величайшими искателями морских приключений. Сюжет сосредоточен вокруг трех лучших друзей, Финна, Сэм и Эндрю, попавших в класс аутсайдеров под названием Планктоны, который возглавляет эксцентричная женщина-пират Шарлотта Ле Крекерс. Благодаря храбрости, нестандартному мышлению и слаженной командной работе главные герои становятся самыми выдающимися учениками-пиратами в истории академии.