После гибели Цезаря сменяется несколько поколений. За это время обезьяны стали доминирующим видом на планете, в то время как люди окончательно одичали и утратили способность говорить. Главный герой истории – молодой шимпанзе по имени Ноа, который остается совсем один, когда его отца убивают, а всех остальных соплеменников порабощают представители воинствующего прибрежного клана под предводительством высокомерного бонобо Проксимуса Цезаря, который одержим поисками старых человеческих технологий. Чтобы спасти своих сородичей, Ноа объединяет усилия с неравнодушным орангутангом Ракой и молодой женщиной Мэй. Последняя, каким-то образом сумевшая сохранить разум и речь, в этом путешествии преследует собственные цели.