В 2022 году люди, ведущие ожесточенную войну против разумных машин, заполучают секретные данные, которые дают им надежду на победу. Сразу после этого SkyNet отправляет терминатора в 1997 год, в момент незадолго до Судного дня, чтобы найти и ликвидировать в Японии гениального ученого Малкольма Ли. Мужчина является важной целью, поскольку разрабатывает еще одну систему искусственного интеллекта под названием Kokoro, способную составить конкуренцию SkyNet. Чтобы не допустить гибели ученого, люди посылают на перехват терминатору молодую женщину-солдата по имени Эйко.