В 1950-е годы Хеллбой и его молодая напарница-новичок Бобби Джо Сонг, работающие в агентстве паранормальных исследований, сопровождают на поезде контейнер с огромным демоническим пауком. Членистоногое существо неожиданно вырывается на свободу и провоцирует аварию, в результате чего двое агентов едва не погибают и теряются где-то среди лесистой местности Аппалачей. Перед тем как вернуться на базу, главные герои берутся разгадать мрачный секрет небольшой местной общины, которую возглавляет зловещий горбун Джеремайя Уиткинс.